★新シナリオとイベント画像の追加で、まだ見たことのないエヴァワールドが展開 もちろん新シナリオは、オリジナル声優陣による新規録音 ★山下いくとデザインによる「雷電」が超美麗ムービーで動く ★美麗なハイビジョンTV（16：9）の高画質表示で、名シーンもさらに美しく！ ★サラウンド5.1ｃｈ対応の音声出力で戦闘シーンも臨場感いっぱい！ ★パッケージは新たに平松禎史が描き下し！ ★オリジナル特典DVDが付いてくる
満月の夜に第3新東京市を謎の爆撃が襲う。しかし奇妙なことにネルフは出動を命じられない。 使徒とは違う、別の敵が…？ その翌朝、シンジたちのクラスに一人の美少女が転校してくる。名前は霧島マナ。彼女は、シンジに急接近を試みる。ネルフとエヴァの情報をねらうスパイではないかと疑うアスカ。しかしシンジの心は、マナの率直すぎる行動に揺れ動いていた…。
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